科技日?qǐng)?bào)訊 (洪恒飛 王楨干 記者江耘)近日，科技日?qǐng)?bào)記者從浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院獲悉，該院感染科俞云松教授與陳衍博士課題組通過(guò)首創(chuàng)的頭狀葡萄球菌核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)，揭示了利奈唑胺耐藥頭狀葡萄球菌的克隆傳播和耐藥機(jī)制，為多重耐藥病原體的流行病學(xué)監(jiān)測(cè)提供了可靠的分子分型工具。相關(guān)研究論文近日發(fā)表在國(guó)際期刊《自然·通訊》上。
頭狀葡萄球菌是一種常見(jiàn)的凝固酶陰性葡萄球菌，可導(dǎo)致乳腺炎、復(fù)雜皮膚軟組織感染、人工關(guān)節(jié)感染等嚴(yán)重感染。長(zhǎng)期使用利奈唑胺這一抗菌藥，會(huì)使頭狀葡萄球菌產(chǎn)生耐藥性。核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)是把以大量菌株為基礎(chǔ)的核心基因組作為序列分型標(biāo)記，從而構(gòu)建的高分辨率的物種分型技術(shù)。利用核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)進(jìn)行細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)研究，有助于預(yù)測(cè)細(xì)菌耐藥發(fā)展變化趨勢(shì)，明確耐藥機(jī)制，從而引導(dǎo)抗菌藥物研發(fā)。
此次研究中，課題組應(yīng)用了3個(gè)不同的頭狀葡萄球菌基因組集，經(jīng)過(guò)初步篩選和驗(yàn)證基因組集篩選，最終建立了包含1492個(gè)基因的核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)。為驗(yàn)證該系統(tǒng)，課題組收集了目前所有利奈唑胺耐藥頭狀葡萄球菌的基因組作為檢驗(yàn)基因組集，并納入了源于杭州、上海和哈爾濱等地醫(yī)院的菌株的核心基因組。
“盡管菌株之間時(shí)空差異很大，但絕大多數(shù)利奈唑胺耐藥頭狀葡萄球菌均屬于同一克隆，即該細(xì)菌同一進(jìn)化分枝。團(tuán)隊(duì)建立的系統(tǒng)分析鑒定發(fā)現(xiàn)了重要耐藥克隆，并將其命名為L(zhǎng)克隆�！标愌芙榻B。
陳衍說(shuō)，基于核心基因組單核苷酸多態(tài)性(SNP)系統(tǒng)發(fā)育分析的區(qū)分結(jié)果與頭狀葡萄球菌核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)得出的結(jié)果一致——大部分L克隆菌株攜帶利奈唑胺耐藥基因，該基因由菌株中特定的環(huán)狀DNA分子攜帶，并且只存在于L克隆中。
“雖然L克隆目前只發(fā)現(xiàn)于我國(guó)，但已對(duì)臨床產(chǎn)生威脅，亟須進(jìn)行更大范圍的國(guó)際流行病學(xué)調(diào)查來(lái)監(jiān)測(cè)L克隆的全球性流行和傳播�！标愌芙榻B，期待在完善的核心基因組多位點(diǎn)分型系統(tǒng)的幫助下，人們未來(lái)可以更好地監(jiān)測(cè)多重耐藥頭狀葡萄球菌克隆播散情況。